Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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KCNS3Q9BQ31 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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KCNS3Q9BQ31 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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KCNS3Q9BQ31 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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KCNS3Q9BQ31 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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KCNS3Q9BQ31 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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KCNS3Q9BQ31 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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KCNS3Q9BQ31 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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KCNS3Q9BQ31 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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KCNS3Q9BQ31 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNS3Q9BQ31 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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