Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms