Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms