Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ALS2Q96Q42 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms