Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC9Q96Q05 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms