Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SHDQ96IW2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHDQ96IW2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHDQ96IW2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SHDQ96IW2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHDQ96IW2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHDQ96IW2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHDQ96IW2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHDQ96IW2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHDQ96IW2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHDQ96IW2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHDQ96IW2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHDQ96IW2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHDQ96IW2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHDQ96IW2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHDQ96IW2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHDQ96IW2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SHDQ96IW2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHDQ96IW2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHDQ96IW2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHDQ96IW2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHDQ96IW2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHDQ96IW2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHDQ96IW2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms