Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms