Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD50Q92878 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAD50Q92878 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAD50Q92878 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAD50Q92878 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RAD50Q92878 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAD50Q92878 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms