Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms