Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX29Q8TEQ0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29Q8TEQ0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms