Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3RF3Q8TEJ3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms