Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNERQ8NFT8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNERQ8NFT8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms