Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE23Q8NDY6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms