Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF248Q8NDW4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF248Q8NDW4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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