Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC191Q8NCU4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC191Q8NCU4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms