Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAAF3Q8N9W5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms