Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTBP4Q8N2S1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTBP4Q8N2S1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms