Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms