Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BBS12Q6ZW61 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms