Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP6Q6ZN66 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP6Q6ZN66 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP6Q6ZN66 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP6Q6ZN66 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP6Q6ZN66 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP6Q6ZN66 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP6Q6ZN66 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP6Q6ZN66 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP6Q6ZN66 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP6Q6ZN66 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP6Q6ZN66 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP6Q6ZN66 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP6Q6ZN66 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP6Q6ZN66 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms