Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms