Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H3F3CQ6NXT2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms