Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLX4IPQ5VYV7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms