Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
FAM69BQ5VUD6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM69BQ5VUD6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM69BQ5VUD6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM69BQ5VUD6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM69BQ5VUD6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM69BQ5VUD6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM69BQ5VUD6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM69BQ5VUD6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM69BQ5VUD6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM69BQ5VUD6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM69BQ5VUD6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM69BQ5VUD6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM69BQ5VUD6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM69BQ5VUD6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM69BQ5VUD6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM69BQ5VUD6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM69BQ5VUD6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM69BQ5VUD6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM69BQ5VUD6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM69BQ5VUD6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM69BQ5VUD6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms