Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC01545Q5VT33 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC01545Q5VT33 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms