Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms