Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRMS1LQ5PSV4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms