Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms