Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms