Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms