Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP41Q3LFD5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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USP41Q3LFD5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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USP41Q3LFD5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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USP41Q3LFD5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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USP41Q3LFD5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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USP41Q3LFD5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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USP41Q3LFD5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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USP41Q3LFD5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP41Q3LFD5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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