Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms