Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
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