Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSX1Q16384 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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