Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
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