Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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