Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 GNAI2-210ENST00000490122 2445 ntTSL 214.87□□□□□ -0.036e-7■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.036e-7■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.151e-6■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 PPP2R5C-227ENST00000557268 2013 ntTSL 215.22■□□□□ 0.031e-6■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 PPP2R5C-209ENST00000553890 492 ntTSL 312.64□□□□□ -0.391e-6■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 PPP2R5C-212ENST00000554442 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.591e-6■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 PPP2R5C-201ENST00000328724 4045 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.791e-6■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 PPP2R5C-215ENST00000556068 3363 ntTSL 26.89□□□□□ -1.311e-6■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 PPP2R5C-213ENST00000554504 448 ntTSL 36.09□□□□□ -1.431e-6■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.423e-7■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 ACTN4-211ENST00000589528 441 ntTSL 216.97■□□□□ 0.313e-7■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 ACTN4-204ENST00000440400 3180 ntTSL 514.11□□□□□ -0.153e-7■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 SMAP2-202ENST00000372718 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)17.87■□□□□ 0.455e-7■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 KHSRP-205ENST00000595223 956 ntTSL 519.6■□□□□ 0.731e-7■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.073e-8■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 LIME1-210ENST00000621325 2410 ntTSL 222.35■■□□□ 1.171e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.061e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 LIME1-209ENST00000494776 391 ntTSL 517.65■□□□□ 0.421e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.181e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 CTSB-225ENST00000532409 839 ntTSL 217.14■□□□□ 0.338e-8■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 CTSB-227ENST00000533110 399 ntTSL 510.27□□□□□ -0.778e-8■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 CTSB-216ENST00000530290 498 ntTSL 36.33□□□□□ -1.48e-8■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 TRIR-204ENST00000591254 988 ntTSL 228.47■■■□□ 2.152e-15■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.093e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 PHYKPL-211ENST00000494126 2297 ntTSL 1 (best)26.35■■□□□ 1.813e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.782e-15■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 AHSA2-204ENST00000463681 453 ntTSL 526.01■■□□□ 1.753e-11■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 PHYKPL-204ENST00000474052 1539 ntTSL 1 (best)25.6■■□□□ 1.693e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.642e-15■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.63e-11■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.512e-15■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.311e-8■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 CRTC2-201ENST00000303569 2290 ntTSL 523.02■■□□□ 1.283e-11■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.123e-11■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 FBXO17-203ENST00000596025 935 ntTSL 221.93■■□□□ 1.11e-8■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.061e-8■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.013e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.963e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 PHYKPL-213ENST00000506001 583 ntTSL 321.04■□□□□ 0.963e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 PHYKPL-209ENST00000489262 2780 ntTSL 221.01■□□□□ 0.953e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 LARP1-204ENST00000518297 2630 ntTSL 520.99■□□□□ 0.956e-7■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 PFAS-204ENST00000580251 559 ntTSL 320.39■□□□□ 0.853e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 PHYKPL-210ENST00000493197 1969 ntTSL 220.34■□□□□ 0.853e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 TRIR-203ENST00000589590 930 ntTSL 220.06■□□□□ 0.82e-15■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.773e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 YIPF3-208ENST00000490447 1321 ntTSL 219.82■□□□□ 0.763e-11■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 PFAS-203ENST00000578979 765 ntTSL 219.15■□□□□ 0.663e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 IP6K2-227ENST00000479914 1077 ntTSL 1 (best)19■□□□□ 0.633e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.633e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 WDR26-208ENST00000486652 2867 ntTSL 1 (best)18.38■□□□□ 0.533e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.493e-11■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.433e-11■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.423e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 IP6K2-212ENST00000433104 2490 ntTSL 217.57■□□□□ 0.43e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.253e-11■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.23e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 LARP1-215ENST00000524248 2128 ntTSL 516.23■□□□□ 0.196e-7■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.183e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 PFAS-202ENST00000546020 2652 ntTSL 216.08■□□□□ 0.163e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.82■□□□□ 0.124e-10■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 TMEM94-212ENST00000579898 2596 ntTSL 215.58■□□□□ 0.081e-8■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 CRTC2-207ENST00000487235 2263 ntTSL 214.96□□□□□ -0.013e-11■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 IP6K2-207ENST00000416707 1260 ntTSL 1 (best)14.81□□□□□ -0.043e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.063e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 IP6K2-220ENST00000449563 580 ntTSL 414.69□□□□□ -0.063e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.13e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 IP6K2-203ENST00000412795 750 ntTSL 314.28□□□□□ -0.123e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.133e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.133e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.183e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 IP6K2-214ENST00000436134 631 ntTSL 313.88□□□□□ -0.193e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 IP6K2-206ENST00000413654 553 ntTSL 413.75□□□□□ -0.213e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 YIPF3-211ENST00000503147 652 ntTSL 213.71□□□□□ -0.213e-11■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 IP6K2-225ENST00000455545 539 ntTSL 313.68□□□□□ -0.223e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.243e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 IP6K2-222ENST00000450045 689 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.263e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 IP6K2-224ENST00000454335 631 ntTSL 413.4□□□□□ -0.263e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 CRTC2-210ENST00000524997 1050 ntTSL 213.39□□□□□ -0.273e-11■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 PHYKPL-218ENST00000514424 584 ntTSL 413.34□□□□□ -0.273e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 PHYKPL-202ENST00000323594 739 ntTSL 513.34□□□□□ -0.273e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.293e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.33e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 IP6K2-219ENST00000446860 1565 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.363e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 PHYKPL-208ENST00000481811 2709 ntTSL 212.79□□□□□ -0.363e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 PFAS-205ENST00000580356 4242 ntTSL 212.78□□□□□ -0.363e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 TKFC-218ENST00000533853 460 ntTSL 312.68□□□□□ -0.383e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 IP6K2-218ENST00000443964 973 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.413e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 SRC-203ENST00000373567 4321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.413e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 IP6K2-208ENST00000417896 1124 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.423e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 PHYKPL-216ENST00000510991 814 ntTSL 312.4□□□□□ -0.423e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 KANSL1-215ENST00000576870 2848 ntTSL 212.29□□□□□ -0.443e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 CRTC2-204ENST00000461638 2343 ntTSL 1 (best)12.24□□□□□ -0.453e-11■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 LARP1-206ENST00000518677 827 ntTSL 512.19□□□□□ -0.461e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 SRC-207ENST00000477066 3300 ntTSL 212.06□□□□□ -0.483e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 IP6K2-210ENST00000431721 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.493e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 C2orf72-202ENST00000463834 3141 ntTSL 1 (best)11.66□□□□□ -0.543e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 IP6K2-204ENST00000412850 543 ntTSL 411.59□□□□□ -0.553e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 SRC-201ENST00000358208 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.613e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 AC099811.2-202ENST00000592248 694 ntTSL 311.25□□□□□ -0.613e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.733e-6■■■□□ 17.8
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