Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms