Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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