Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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ITGA9Q13797 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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ITGA9Q13797 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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ITGA9Q13797 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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ITGA9Q13797 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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ITGA9Q13797 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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ITGA9Q13797 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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