Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
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