Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms