Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLD1Q13393 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLD1Q13393 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLD1Q13393 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PLD1Q13393 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLD1Q13393 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLD1Q13393 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLD1Q13393 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLD1Q13393 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLD1Q13393 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLD1Q13393 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PLD1Q13393 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLD1Q13393 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLD1Q13393 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms