Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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