Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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