Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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TRAF3Q13114 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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