Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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