Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
GRIN2AQ12879 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
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