Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms