Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms